Мутантам приходится все сложнее в мире, который находится под руководством людей без сверхспособностей. После того, как они вышли из тени, между мутантами Ксавьера и Магнето завязалась настоящая война. Причем последние хотят поработить человечество, а первые - добиться нормальных условий существования для мутантов. Очередный общественный взрыв становится результатом атаки некоего неизвестного врага, обладающего невероятными способностями, а занчит, несущего серьезную угрозу миру. Тем временем, для мутантов вводится специальная система регистрации, а ряд граждан создают движение, борящееся с мутантами под руководством Страйкера.